RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	OR10J4	P0C629	311 aa		7.76	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.76	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GGTLC3	B5MD39	225 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE1	Q13065	139 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE4	Q13068	117 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE5	Q13069	117 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	RAB31	Q13636	194 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		7.75	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	RBAKDN	A6NC62	111 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	NIT1	Q86X76	327 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	OR51M1	Q9H341	326 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	COX11	Q9Y6N1	276 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557		V9GYH0	126 aa		7.74	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	IGSF23	A1L1A6	192 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	DIRC3	C9JPN6	131 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557		F6UZH7	168 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	CCS	O14618	274 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS1	P07477	247 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	BAX	Q07812	192 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.73	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	INPP1	P49441	399 aa		7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	BCAP31	P51572	246 aa		7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	PYDC2	Q56P42	97 aa		7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	LINC01600	Q96MT4	127 aa		7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		7.72	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	MUC2	Q02817	5179 aa		7.71	□□□□□ -1.17
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFB6	O95139	128 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	FGF7	P21781	194 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	RMI2	Q96E14	147 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf85	Q96MD7	179 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	JPT2	Q9H910	190 aa		7.71	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	USP17L23	D6RBM5	183 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557		L7N2F9	121 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	AP3S2	P59780	193 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP10-8	P60410	259 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	VAMP2	P63027	116 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		7.7	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	CIDEA	O60543	219 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	MITD1	Q8WV92	249 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	ASB13	Q8WXK3	278 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	HYLS1	Q96M11	299 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00479	Q96M42	142 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	PARL	Q9H300	379 aa		7.69	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	S100A11	P31949	105 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	BTC	P35070	178 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	CSN1S1	P47710	185 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	SULT1A1	P50225	295 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	TMED6	Q8WW62	240 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	SGK494	Q96LW2	274 aa		7.68	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	IL15RA	Q13261	267 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	PTH2	Q96A98	100 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf50	Q96LR7	162 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	TREM1	Q9NP99	234 aa		7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WWC5	75 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557		A0A0D9SG52	128 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	NHLH2	Q02577	135 aa		7.66	□□□□□ -1.18
BBS1-222	ENST00000533557	C14orf177	Q52M58	125 aa		7.66	□□□□□ -1.18

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