RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531318.1

NFRKB-208, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, human

TSL 4

Gene NFRKB, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFRKB-208	ENST00000531318	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318		Q6ZSA8	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	OXT	P01178	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF266	Q14584	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318		F6UZH7	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	OR7C2	O60412	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TYMS	P04818	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	S100A11	P31949	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SULT1A1	P50225	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TIRAP	P58753	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	HBG1	P69891	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	HBG2	P69892	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RHOH	Q15669	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	LELP1	Q5T871	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318		Q6AWC8	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	STX12	Q86Y82	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TNXB	P22105	4242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	CENPX	A8MT69	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	LAGE3	Q14657	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ATP5S	Q99766	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	LRP2	P98164	4655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RS1	O15537	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	BTC	P35070	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE1	Q13065	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE4	Q13068	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE5	Q13069	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	RAB32	Q13637	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	NMES1	Q9C002	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	NHLH2	Q02577	135 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318		Q8N976	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NFRKB-208	ENST00000531318	PGP	A6NDG6	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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