RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515393.5

MCTP1-218, Transcript of multiple C2 and transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MCTP1, Length 5,396 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1-218ENST00000515393 DKK2Q9UBU2 259 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 XCL2Q9UBD3 114 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 USF3Q68DE3 2245 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.7□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 C22orf46C9J442 243 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CDK2AP2O75956 126 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CFHR4Q92496 578 aa14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CITED1Q99966 193 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.68□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 K7EIM0 57 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 DAD1P61803 113 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 KNCNA6PVL3 124 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CFC1BP0CG36 223 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CFC1P0CG37 223 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 DEFB130BP0DP73 79 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 DEFB130AP0DP74 79 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 RNF223E7ERA6 249 aa14.67□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 NBL1P41271 181 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CARD19Q96LW7 228 aa14.66□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 CRYGCP07315 174 aa14.65□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 PATE2Q6UY27 113 aa14.65□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 C17orf77Q96MU5 243 aa14.65□□□□□ -0.06
MCTP1-218ENST00000515393 RMI2Q96E14 147 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 MED13LQ71F56 2210 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 TMEM89A2RUT3 159 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGKV1-17P01599 117 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.64□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 H3BQ85 93 aa14.63□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 CTRLP40313 264 aa14.63□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 CREBBPQ92793 2442 aa14.63□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 H3BMG7 143 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGLV2-14P01704 120 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGLV2-23P01705 113 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 ABCA4P78363 2273 aa14.62□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 K7EMT4 169 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 P0C879 139 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 MAJINQ3KP22 176 aa14.61□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 GAGE7O76087 117 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 GAGE12FP0CL80 117 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 GAGE12GP0CL81 117 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 GAGE12IP0CL82 117 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 COL4A3Q01955 1670 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 IGLL5B9A064 214 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 DKK4Q9UBT3 224 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 CTSGP08311 255 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.6□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 K7ERJ3 54 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 BUB3O43684 328 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 GAGE6Q13070 117 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 MORN5Q5VZ52 161 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 PSCAO43653 123 aa14.59□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 PFN2P35080 140 aa14.58□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.58□□□□□ -0.07
MCTP1-218ENST00000515393 DSCR8Q96T75 97 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 F5H768 121 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 SPRY4Q9C004 299 aa14.58□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 TEX22C9J3V5 150 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 PCP2Q8IVA1 136 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 PRSS33Q8NF86 280 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 TIMM17AQ99595 171 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 GNRH2O43555 120 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 Q96MF0 132 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.57□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 H0YGX0 51 aa14.56□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 CRLF1O75462 422 aa14.56□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 IGLV1-47P01700 117 aa14.56□□□□□ -0.08
MCTP1-218ENST00000515393 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms