RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CXCL2P19875 107 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 LEPP41159 167 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF138P52744 262 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PLP1P60201 277 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL2L11O43521 198 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 AZU1P20160 251 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 MED9Q9NWA0 146 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 H7BYZ3 331 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 MIFP14174 115 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FXYD5Q96DB9 178 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM74A7A6NL05 159 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLC2P0DOY2 106 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 KLK9Q2XQG4 91 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CELA1Q9UNI1 258 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 SFTA3P0C7M3 94 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CASC10Q5T4H9 136 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZQT7 251 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 OTORQ9NRC9 128 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PRELID1Q9Y255 219 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf71A4D174 169 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB19A4D1S5 217 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5G3P48201 142 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE2BQ13066 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE2EQ4V326 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.73□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf94C9JXX5 98 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNA1P01562 189 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZNX1 250 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PSG8Q9UQ74 426 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 M0R381 172 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 AMBPP02760 352 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 SMUG1Q53HV7 270 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC51BQ86UW2 128 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 BAGE2Q86Y30 109 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB13Q8WXK3 278 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 ANK2Q01484 3957 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C3orf84H3BNL1 204 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 GNRH2O43555 120 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB14P61106 215 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE6HQ13956 83 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 EPDR1Q9UM22 224 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.72□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 NUPR2A6NF83 97 aa4.71□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 UMAD1C9J7I0 102 aa4.71□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.71□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.71□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf49Q96NF6 230 aa4.71□□□□□ -1.65
RRN3P1-201ENST00000514813 HMSDA8MTL9 139 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SOCS3O14543 225 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TCRAP04437 139 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5G1P05496 136 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZTI0 123 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 Q75L30 129 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SYT8Q8NBV8 401 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PEX7O00628 323 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 C1QBP02746 253 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TAS2R60P59551 318 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 COL7A1Q02388 2944 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 GGTLC3B5MD39 225 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC11BP0C7V7 166 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms