RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLURP1	P55000	103 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAGE7	O76087	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00158	P58513	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LTA	P01374	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CGB3	P0DN86	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CGB7	P0DN87	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GP9	P14770	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PLN	P26678	52 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	HSD52	Q0P140	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CFHR4	Q92496	578 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRP	P02741	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MTOR	P42345	2549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	POLQ	O75417	2590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	EREG	O14944	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	BUB3	O43684	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	AZU1	P20160	251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LMO4	P61968	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		A0A096LPF7	62 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		F5H768	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		Q8N8P6	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CCL24	O00175	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		P0C879	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PAX2	Q02962	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRORY	Q9H606	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	NUPR1	O60356	82 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CKS1B	P61024	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SEC11A	P67812	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		H3BUA1	57 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PAX4	O43316	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		A0A087WW49	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654		A0A1B0GV72	72 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ESD	P10768	282 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGLL1	P15814	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CDSN	Q15517	529 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRYGC	P07315	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATP2C1-222	ENST00000514654	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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