RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506787.5

UBE2B-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 TMEM213A2RRL7 107 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 DIRC3C9JPN6 131 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 K7EN84 100 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 ISLRO14498 428 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 AMBPP02760 352 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 MT-ND4LP03901 98 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 AKR1C3P42330 323 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 RNF212Q495C1 297 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 AGRNO00468 2067 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF320A2RRD8 509 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 SOCS3O14543 225 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 HLA-DMBP28068 263 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 GNG4P50150 75 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 GNG5P63218 68 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 ADIRFQ15847 76 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 CENPWQ5EE01 88 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 BAGE2Q86Y30 109 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 FMC1Q96HJ9 113 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 IMMP2LQ96T52 175 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 OSTCQ9NRP0 149 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-205ENST00000506787 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 M0R3E3 92 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 PPP1R2P9O14990 202 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 LTAP01374 205 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 ELOBQ15370 118 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 CSTL1Q9H114 145 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 RBAKDNA6NC62 111 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 PSG3Q16557 428 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 Q8NAQ8 132 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SFRP2Q96HF1 295 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 PSG8Q9UQ74 426 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 PRAC2D3DTV9 90 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 CSN1S1P47710 185 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 OR5I1Q13606 314 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 Q5VSD8 79 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 NRN1Q9NPD7 142 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF492Q9P255 531 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 V9GYV3 84 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 H7BYZ3 331 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 K7EQM0 130 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 CRIP1P50238 77 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 UBE2G1P62253 170 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TCF24Q7RTU0 167 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 DCANP1Q8TF63 244 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 NUDT11Q96G61 164 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SGK494Q96LW2 274 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 BIN3Q9NQY0 253 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 NACAE9PAV3 2078 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 CXCL1P09341 107 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms