RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 TCRAP04437 139 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 SERF2P84101 59 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 RGS21Q2M5E4 152 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 SUN5Q8TC36 379 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 TMED6Q8WW62 240 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 LINC00479Q96M42 142 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 UPK3BQ9BT76 320 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.29□□□□□ -1.24
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NELFE-213ENST00000494956 DNAH2Q9P225 4427 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 ARPC5O15511 151 aa7.28□□□□□ -1.24
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NELFE-213ENST00000494956 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.28□□□□□ -1.24
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NELFE-213ENST00000494956 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-213ENST00000494956 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.27□□□□□ -1.25
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NELFE-213ENST00000494956 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.27□□□□□ -1.25
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NELFE-213ENST00000494956 HERC2O95714 4834 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 C9JCJ5 164 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 K7EQD1 137 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 M0R2P5 195 aa7.26□□□□□ -1.25
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NELFE-213ENST00000494956 GYPEP15421 78 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 ASB13Q8WXK3 278 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 PKD1P98161 4303 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SIVA1O15304 175 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 MED14OSP0DP75 135 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 FHITP49789 147 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 LINC00315P59091 139 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 C16orf90A8MZG2 172 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 K7EQM0 130 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-2P60368 255 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 TTC32Q5I0X7 151 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 PKHD1P08F94 4074 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PRE2 83 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 FAM74A7A6NL05 159 aa7.23□□□□□ -1.25
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NELFE-213ENST00000494956 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SRIP30626 198 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SLAQ13239 276 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SMUG1Q53HV7 270 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 KCNS1Q96KK3 526 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 C9orf85Q96MD7 179 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.23□□□□□ -1.25
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NELFE-213ENST00000494956 A0A1B0GV50 99 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 A0A1W2PPQ1 181 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 PEX7O00628 323 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 TAAR5O14804 337 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 ZNF876PQ49A33 203 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 Q86TA4 180 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 JPT2Q9H910 190 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-213ENST00000494956 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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