RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493608.1

COL6A3-214, Transcript of collagen type VI alpha 3 chain, humanhuman

TSL 2

Gene COL6A3, Length 742 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A3-214ENST00000493608 STAG3L2P0CL84 134 aa7.38□□□□□ -1.23
COL6A3-214ENST00000493608 STAG3L3P0CL85 134 aa7.38□□□□□ -1.23
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COL6A3-214ENST00000493608 ZNF415Q09FC8 603 aa7.38□□□□□ -1.23
COL6A3-214ENST00000493608 Q6AWC8 147 aa7.38□□□□□ -1.23
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COL6A3-214ENST00000493608 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.32□□□□□ -1.24
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COL6A3-214ENST00000493608 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 K7EQM0 130 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 M0R2P5 195 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 NXPH4O95158 308 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 IFNA7P01567 189 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 SLAQ13239 276 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.31□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 A0A1W2PRE2 83 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 K7EQD1 137 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 TAAR5O14804 337 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 SIVA1O15304 175 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 GYPEP15421 78 aa7.3□□□□□ -1.24
COL6A3-214ENST00000493608 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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