RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492354.1

SZRD1-210, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-210ENST00000492354 H3BVH4 76 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 FGF6P10767 208 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 UBE2E1P51965 193 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 CST9LQ9H4G1 147 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 AGRNO00468 2067 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 OOSP1A8MZH6 123 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 M0R381 172 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 IGHV4-39P01824 125 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 EBI3Q14213 229 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.29□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 S100A7P31151 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 KIR3DS1Q14943 382 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 ATP5G2Q06055 141 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 ACANP16112 2415 aa7.28□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 A6NDN8 102 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 TRBV12-3P01733 135 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 SRD5A1P18405 259 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.27□□□□□ -1.24
SZRD1-210ENST00000492354 NPFFO15130 113 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 EFNA4P52798 201 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 CCL19Q99731 98 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 PPBPP02775 128 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SMIM17P0DL12 118 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 FCER1GP30273 86 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SEC11AP67812 179 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.27□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 F6UB75 175 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 PAX8Q06710 450 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 AJUBAQ96IF1 538 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 RAB9AP51151 201 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 LMO4P61968 165 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 LINC01559Q495D7 138 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 A0A0G2JLM5 398 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SAP30O75446 220 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 IGKCP01834 107 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ARL3P36405 182 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ODF1Q14990 250 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 JMJD8Q96S16 334 aa7.26□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 K7ERJ3 54 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 HSD52Q0P140 79 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 PRR9Q5T870 116 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 MGPP08493 103 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 PF4V1P10720 104 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 C20orf173Q96LM9 149 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 FXYD2P54710 66 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 C9orf118A6NHY6 69 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 DPM2O94777 84 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 CDKN1BP46527 198 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 LAGE3Q14657 143 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 Q8N8P6 123 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 CNFNQ9BYD5 112 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 H3BRM9 83 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ATP5J2P56134 94 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 BLCAPP62952 87 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 DPF1Q92782 380 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.22□□□□□ -1.25
SZRD1-210ENST00000492354 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms