RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 MED13Q9UHV7 2174 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 K7EMT4 169 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 NPYP01303 97 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 GAGE6Q13070 117 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 Q8N7P7 452 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 GP9P14770 177 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 HLA-DMBP28068 263 aa13.31□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 DOCK11Q5JSL3 2073 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 C2orf82Q6UX34 121 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 SIRPDQ9H106 197 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 RITA1Q96K30 269 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 F6UB75 175 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 K7EN84 100 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 DLEU1O43261 78 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 HERVK_113P63121 156 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 DEFB136Q30KP8 78 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.3□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-23P01705 113 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 SLURP1P55000 103 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 COL4A3Q01955 1670 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 SIGMAR1Q99720 223 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 F8VRH5 84 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 BUB3O43684 328 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 U3KQE9 123 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGHG2P01859 326 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 OBSL1O75147 1896 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G5P39877 138 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 GNRH2O43555 120 aa13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 CFHR4Q92496 578 aa13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 MSMPQ1L6U9 139 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZWC4 215 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 NRGNQ92686 78 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 VWC2LB2RUY7 222 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TEX22C9J3V5 150 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 GPHB5Q86YW7 130 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 UBE2V1Q13404 147 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 WISP2O76076 250 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 MYCNOSP40205 109 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 C16orf74Q96GX8 76 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 EREGO14944 169 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 PATE2Q6UY27 113 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TMEM131Q92545 1883 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 FSTL3O95633 263 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 IGLC2P0DOY2 106 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 IGLC3P0DOY3 106 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 COX8AP10176 69 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 CDK2AP2O75956 126 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 NCKAP5O14513 1909 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TAL2Q16559 108 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 ACACBO00763 2458 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 PFN2P35080 140 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WW49 117 aa13.23□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 C2orf70A6NJV1 201 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 COX11Q9Y6N1 276 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 IGLV2-14P01704 120 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 A6NDX4 124 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 GAGE2BQ13066 116 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 GAGE2EQ4V326 116 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 PIFOQ8TCI5 191 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-213ENST00000489895 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.21□□□□□ -0.29
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