RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480476.1

NIN-211, Transcript of ninein, humanhuman

TSL 3

Gene NIN, Length 920 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIN-211ENST00000480476 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SYNJ2BPP57105 145 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CCL20P78556 96 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ADIRFQ15847 76 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF726P1Q15940 193 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 COX19Q49B96 90 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LCN12Q6JVE5 192 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 BAGE2Q86Y30 109 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 C3orf56Q8N813 242 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF738Q8NE65 137 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LINC01006Q8NI28 216 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 FXYD5Q96DB9 178 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LINC00477Q96M19 166 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RARRES2Q99969 163 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SCRT1Q9BWW7 348 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 Q9H3A6 140 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 VSIRQ9H7M9 311 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 Q9HAA7 133 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TMEM242Q9NWH2 141 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SMPXQ9UHP9 88 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 EPDR1Q9UM22 224 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 S4R3C0 116 aa3□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 A0A087WWC5 75 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 NDUFAF8A1L188 74 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 A8MWL6 223 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 H7C423 109 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 P01737 135 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TCRAP04437 139 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 PYYP10082 97 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 FOLR2P14207 255 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TMEM183BQ1AE95 376 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LEMD1Q68G75 181 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 Q6AWC8 147 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 PATE2Q6UY27 113 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 C19orf35Q6ZS72 473 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TCF24Q7RTU0 167 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TMEM75Q8N9X5 138 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LINC00052Q96N35 136 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 IMMP2LQ96T52 175 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 OCR1Q9BZK8 76 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RPH3ALQ9UNE2 315 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 RFNGQ9Y644 331 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ATRQ13535 2644 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 HIVEP1P15822 2718 aa2.99□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 F8P00451 2351 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 A0A1B0GW15 77 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 C2orf70A6NJV1 201 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 IGLC2P0DOY2 106 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CBLN1P23435 193 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 LEPP41159 167 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 PSG3Q16557 428 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 GUCA2BQ16661 112 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SMUG1Q53HV7 270 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CENPWQ5EE01 88 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 FAM162BQ5T6X4 162 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SFRP2Q96HF1 295 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF414Q96IQ9 312 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 SMR3AQ99954 134 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CHCHD5Q9BSY4 110 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 TUBA4BQ9H853 241 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ESM1Q9NQ30 184 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 PDZD2O15018 2839 aa2.98□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.97□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.97□□□□□ -1.93
NIN-211ENST00000480476 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms