RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		2.57	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM189	A5PLL7	270 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	C8orf87	E5RJ46	101 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SYNGR1	O43759	233 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ARL6IP5	O75915	188 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TNF	P01375	233 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IGLV3-27	P01718	113 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ATP6V0C	P27449	155 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SMIM11A	P58511	58 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TAS2R20	P59543	309 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	GNG3	P63215	75 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PSG9	Q00887	426 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	LRP11	Q86VZ4	500 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	LINC00471	Q8N535	108 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DEFB125	Q8N687	156 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR8S1	Q8NH09	359 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CHST6	Q9GZX3	395 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ACER3	Q9NUN7	267 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		2.56	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR2T8	A6NH00	312 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541		K7EP34	96 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	DEGS1	O15121	323 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CYB5A	P00167	134 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CA2	P00918	260 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IFNA1	P01562	189 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IGKV1-17	P01599	117 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PRH1	P02810	166 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TYMS	P04818	313 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	REG1A	P05451	166 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	KRTAP10-1	P60331	282 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	LCN6	P62502	163 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	INSL4	Q14641	139 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	MSMO1	Q15800	293 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ADIRF	Q15847	76 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	MPV17L	Q2QL34	196 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	C10orf111	Q8N326	155 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	C3orf56	Q8N813	242 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR2M3	Q8NG83	312 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PATE1	Q8WXA2	126 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	AQP3	Q92482	292 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	RAB8B	Q92930	207 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	AP1S3	Q96PC3	154 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TRIB3	Q96RU7	358 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	VSIR	Q9H7M9	311 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PLCE1	Q9P212	2302 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PCTP	Q9UKL6	214 aa		2.55	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	PLXNB1	O43157	2135 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	OR51F1	A6NGY5	319 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541		F5H5K5	113 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF216-208	ENST00000479541		H7C1C5	153 aa		2.54	□□□□□ -2

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