RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467095.5

SYN3-208, Transcript of synapsin III, human

TSL 3

Gene SYN3, Length 742 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYN3-208	ENST00000467095	GNRH2	O43555	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	MIF	P14174	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	PPT1	P50897	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	LINC01587	Q99440	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		H7BYZ3	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		K7EN84	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	GCG	P01275	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TYMS	P04818	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TSPO	P30536	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	AKR1C3	P42330	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TAS2R60	P59551	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SH2D1A	O60880	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	HTN1	P15515	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	PARL	Q9H300	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		K7EQM0	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	RGS13	O14921	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	PDE6D	O43924	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	EMP1	P54849	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	UBE2G1	P62253	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	OR5I1	Q13606	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		Q6ZTC4	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	SPINK4	O60575	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	IFNA1	P01562	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TCL1A	P56279	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		Q6ZTI0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	CBY3	A6NI87	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		C9JCJ5	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095		M0R036	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYN3-208	ENST00000467095	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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