RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462078.1

POLR1A-205, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 469 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-205ENST00000462078 A0A1W2PRE2 83 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 GGTLC3B5MD39 225 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 PAX4O43316 350 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 GNRH2O43555 120 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TYMSP04818 313 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TNP2Q05952 138 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 EPDR1Q9UM22 224 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 M0R2P5 195 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TAAR5O14804 337 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 MED14OSP0DP75 135 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 SVIPQ8NHG7 77 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 PTH2Q96A98 100 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF479Q96JC4 524 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 KCNS1Q96KK3 526 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 PSG8Q9UQ74 426 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-205ENST00000462078 HERC1Q15751 4861 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 F6UZH7 168 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 IGHV3-53P01767 116 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TTC32Q5I0X7 151 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SGK494Q96LW2 274 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 C8orf49Q96NF6 230 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 FAM74A7A6NL05 159 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 K7EQD1 137 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 K7EQM0 130 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SFTA3P0C7M3 94 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 C9orf85Q96MD7 179 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 HMSDA8MTL9 139 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SIVA1O15304 175 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 ARPC5O15511 151 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 GCGP01275 180 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 ORM1P02763 201 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF345Q14585 488 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SMUG1Q53HV7 270 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 ZNF575Q86XF7 245 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 LINC00479Q96M42 142 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 NAGKQ9UJ70 344 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SMLR1H3BR10 107 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 RS1O15537 224 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 CIDEAO60543 219 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 NXPH4O95158 308 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 FHITP49789 147 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TIRAPP58753 221 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 DNLZQ5SXM8 178 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 PRNTQ86SH4 94 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 HSPG2P98160 4391 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 PEX7O00628 323 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 SEC11BP0C7V7 166 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 GYPEP15421 78 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 CRIP1P50238 77 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 LINC00315P59091 139 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-205ENST00000462078 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.53□□□□□ -1.36
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