RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RGS21Q2M5E4 152 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RASL10AQ92737 203 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRO0255Q9UI72 69 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MBP02144 154 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPXQ9BT56 116 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXorf1O96002 111 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PSG8Q9UQ74 426 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPG2P98160 4391 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00479Q96M42 142 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EPDR1Q9UM22 224 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARPC5O15511 151 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2G2P60604 165 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRNTQ86SH4 94 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R2P5 195 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NXPH4O95158 308 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GCGP01275 180 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TTC32Q5I0X7 151 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EQD1 137 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MED14OSP0DP75 135 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1W2PRE2 83 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GYPEP15421 78 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00315P59091 139 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1W2PPQ1 181 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM74A7A6NL05 159 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SIVA1O15304 175 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLAQ13239 276 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9orf85Q96MD7 179 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FHITP49789 147 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMUG1Q53HV7 270 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNS1Q96KK3 526 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9JCJ5 164 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EQM0 130 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PEX7O00628 323 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q86TA4 180 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C16orf90A8MZG2 172 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SRIP30626 198 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP10-2P60368 255 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAAR5O14804 337 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RS1O15537 224 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IFNA7P01567 189 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF876PQ49A33 203 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZFP69Q49AA0 526 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ORM1P02763 201 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRIP1P50238 77 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms