RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 NEGR1Q7Z3B1 354 aa18.33■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 TVP23CQ96ET8 276 aa18.33■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 F6UZH7 168 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 NXPH4O95158 308 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 ORM1P02763 201 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 ZNF479Q96JC4 524 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa18.32■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 Q5BKY6 102 aa18.31■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 SH3BGRL3Q9H299 93 aa18.31■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 PCLOQ9Y6V0 5065 aa18.31■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 GNRH2O43555 120 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 TYMSP04818 313 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 SFTA3P0C7M3 94 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 SRIP30626 198 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 LYPD5Q6UWN5 251 aa18.3■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 OR4C5Q8NGB2 326 aa18.29■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 LRP1BQ9NZR2 4599 aa18.29■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 RNF222A6NCQ9 220 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 C9JCJ5 164 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 K7EQD1 137 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 ZFP69Q49AA0 526 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 OR2T35Q8NGX2 323 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 PSG8Q9UQ74 426 aa18.28■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 TAAR5O14804 337 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 LINC00315P59091 139 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 TMEM75Q8N9X5 138 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 EPDR1Q9UM22 224 aa18.27■□□□□ 0.52
ODC1-204ENST00000446285 A0A1W2PRE2 83 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 GGTLC3B5MD39 225 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 K7EP13 123 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 GYPEP15421 78 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 SH2D6Q7Z4S9 175 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 SGK494Q96LW2 274 aa18.26■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 PFN1P07737 140 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 RGS21Q2M5E4 152 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 SMUG1Q53HV7 270 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa18.25■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 CIDEAO60543 219 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 CDK2AP2O75956 126 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 GCGP01275 180 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 IGLV2-11P01706 119 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 SPATA12Q7Z6I5 190 aa18.24■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 PRNTQ86SH4 94 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 NFE4Q86UQ8 179 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 LY96Q9Y6Y9 160 aa18.22■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 HSPG2P98160 4391 aa18.21■□□□□ 0.51
ODC1-204ENST00000446285 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 PPT1P50897 306 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 ZNF876PQ49A33 203 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 PTH2Q96A98 100 aa18.2■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 TIRAPP58753 221 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 ZNF726P1Q15940 193 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 C9orf85Q96MD7 179 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 C11orf21Q9P2W6 132 aa18.19■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 EVI2AP22794 236 aa18.18■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 G3V3Q6 166 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 IFNA7P01567 189 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 BOLA1Q9Y3E2 137 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 EREGO14944 169 aa18.16■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 ARPC5O15511 151 aa18.16■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 RS1O15537 224 aa18.16■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 DNAH10OSP0CZ25 163 aa18.16■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 HIST1H2BAQ96A08 127 aa18.16■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 DNAH5Q8TE73 4624 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 CFAP126Q5VTH2 177 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 WFDC10BQ8IUB3 73 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 C10orf126Q8N4M7 172 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 NHLRC2Q8NBF2 726 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 PRADC1Q9BSG0 188 aa18.15■□□□□ 0.5
ODC1-204ENST00000446285 PEX7O00628 323 aa18.14■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 ERVFC1-1P60608 527 aa18.14■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 RHOHQ15669 191 aa18.14■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa18.14■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 FAM74A7A6NL05 159 aa18.13■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 KRTAP10-2P60368 255 aa18.13■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 UBE2G2P60604 165 aa18.13■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa18.13■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 APOBP04114 4563 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 FABP5P3A8MUU1 101 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 ZNF506Q5JVG8 444 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-204ENST00000446285 SLC25A29Q8N8R3 303 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms