RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 UPK3BQ9BT76 320 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-209ENST00000439106 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 CXorf1O96002 111 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 IGLV2-11P01706 119 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 UBE2G2P60604 165 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 PRO0255Q9UI72 69 aa9.52□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.51□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.49□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 KCNS1Q96KK3 526 aa9.48□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 LINC00315P59091 139 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-209ENST00000439106 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-209ENST00000439106 PEX7O00628 323 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 PFDN1O60925 122 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 MED14OSP0DP75 135 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 SLAQ13239 276 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 Q86TA4 180 aa9.46□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GV50 99 aa9.45□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 TAAR5O14804 337 aa9.45□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 C16orf90A8MZG2 172 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.44□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.43□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 RS1O15537 224 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 ORM1P02763 201 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP10-2P60368 255 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 ZNF345Q14585 488 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
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