RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01551Q86U37 167 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 IGLL5B9A064 214 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 GCGP01275 180 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 AKR1C3P42330 323 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 GNG4P50150 75 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZQT7 251 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 BAGE2Q86Y30 109 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 Q8TAT8 98 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 DERL1Q9BUN8 251 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 DKK2Q9UBU2 259 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 APLNQ9ULZ1 77 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.28□□□□□ -1.24
HDLBP-216ENST00000428482 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 PPP1R2P9O14990 202 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 AMBPP02760 352 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 HTN3P15516 51 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2G1P62253 170 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 BTN1A1Q13410 526 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00479Q96M42 142 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 NEU1Q99519 415 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 PSG8Q9UQ74 426 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 HSPG2P98160 4391 aa7.27□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 MT-ND4LP03901 98 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CT45A10P0DMU9 189 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 GNG5P63218 68 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ISOC2Q96AB3 205 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ODF3Q96PU9 254 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 IMMP2LQ96T52 175 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 OSTCQ9NRP0 149 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF492Q9P255 531 aa7.26□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF138P52744 262 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CEBPGP53567 150 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 RRN3P1Q2M238 152 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CENPWQ5EE01 88 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 K7EN84 100 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 HTN1P15515 57 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CRISP2P16562 243 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CDKN1BP46527 198 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 Q86TA4 180 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 VGLL1Q99990 258 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 FAM231BA6NCW3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 M0R036 132 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 SFRP2Q96HF1 295 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CRIP1P50238 77 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 ADIRFQ15847 76 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 RNF212Q495C1 297 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 CT83Q5H943 113 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 PRNTQ86SH4 94 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 NUDT11Q96G61 164 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01587Q99440 93 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM189A5PLL7 270 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DEFB130BP0DP73 79 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DEFB130AP0DP74 79 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DAD1P61803 113 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SMUG1Q53HV7 270 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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