RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TESCQ96BS2 214 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC39Q96DD0 335 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTF3L4Q96K17 158 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERP44Q9BS26 406 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPXQ9BT56 116 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RMND1Q9NWS8 449 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATPIF1Q9UII2 106 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOSR2O14653 212 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GADD45GO95257 159 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTC4O95801 387 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APOA1P02647 267 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANXA8P13928 327 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAS2R41P59536 307 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q0VG73 95 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAS2R42Q7RTR8 314 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C4orf3Q8WVX3 66 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTP4A1Q93096 173 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VPS25Q9BRG1 176 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GINS4Q9BRT9 223 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLN6Q9NWW5 311 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MROH1Q8NDA8 1641 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A6NDN8 102 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFAP73A6NFT4 308 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BT86 120 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HUS1O60921 280 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNX4O95219 450 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COX4I1P13073 169 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAS2R60P59551 318 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C5orf64Q2M2E5 130 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AARDQ4LEZ3 155 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXO48Q5FWF7 155 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q6JHZ5 121 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CASC1Q6TDU7 716 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFAF7Q7L592 441 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOOK3Q86VS8 718 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNRGQ8N5I3 272 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PQLC3Q8N755 202 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR1L4Q8NGR5 311 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5K2Q8NHB8 316 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR52E6Q96RD3 313 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM107BQ9H098 131 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM138Q9NPI0 162 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXW2Q9UKT8 454 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCC8Q09428 1581 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C17orf112F2Z3M2 114 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMKR1H3BMG3 65 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BRM9 83 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 K7ERQ8 282 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R2P9O14990 202 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSF2BPO75031 334 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PMP2P02689 132 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RHOCP08134 193 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RALBP11234 206 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRDX6P30041 224 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RHOAP61586 193 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VBP1P61758 197 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NIPAL3Q6P499 406 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OOSP2Q86WS3 158 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GDPD1Q8N9F7 314 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC112Q8NEF3 446 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR51A7Q8NH64 312 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AP1S3Q96PC3 154 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B9D1Q9UPM9 204 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP5Q13017 1502 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HFM1A2PYH4 1435 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 D6R8Y8 96 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H0Y8G0 127 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 I3L521 148 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 J3KRW8 73 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 J3QRK9 145 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINE2P07093 398 aa-3.46□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms