RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5G1P05496 136 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5G3P48201 142 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2G2P60604 165 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2G1P62253 170 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ERCC8Q13216 396 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 FMC1Q96HJ9 113 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 VGLL1Q99990 258 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 TREM1Q9NP99 234 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.4□□□□□ -1.54
SGMS1-201ENST00000361543 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 CBY3A6NI87 242 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SNURFLB1AK76 121 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 F5H768 121 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PDE6DO43924 150 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 BTN1A1Q13410 526 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RNF212Q495C1 297 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SMUG1Q53HV7 270 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 Q6AWC8 147 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 KCNS1Q96KK3 526 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PSG8Q9UQ74 426 aa5.39□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 M0R2N4 97 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PAGE4O60829 102 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 AKR1C3P42330 323 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GNG5P63218 68 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 Q8TAT8 98 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GNG13Q9P2W3 67 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.38□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GV50 99 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE12BA1L429 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE7O76087 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT3O95989 172 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE12FP0CL80 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE12GP0CL81 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE12IP0CL82 117 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 BCL2P10415 239 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF415Q09FC8 603 aa5.37□□□□□ -1.55
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SGMS1-201ENST00000361543 TDRG1Q3Y452 100 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PRR9Q5T870 116 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PRNTQ86SH4 94 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM12Q96EX1 92 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.37□□□□□ -1.55
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SGMS1-201ENST00000361543 VAX2Q9UIW0 290 aa5.37□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GCGP01275 180 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 OR5I1Q13606 314 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZTI0 123 aa5.36□□□□□ -1.55
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SGMS1-201ENST00000361543 Q86TA4 180 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf52Q96A22 123 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 SPXQ9BT56 116 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 MUC4Q99102 2169 aa5.36□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RYR1P21817 5038 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM250H0YL14 139 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RTL8CO15255 209 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 LTAP01374 205 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-11P01706 119 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA5P20719 270 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TCL1AP56279 114 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 RAB14P61106 215 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 TEX261Q6UWH6 196 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZQT7 251 aa5.35□□□□□ -1.55
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZR54 194 aa5.35□□□□□ -1.55
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