RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PIP4P1Q86T03 277 aa16.64■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA9B4DS77 424 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE6Q13070 117 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 MGAMO43451 1857 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 Q96MF0 132 aa16.63■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 UBL5Q9BZL1 73 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf153Q5TBE3 101 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.62■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf74Q32Q52 190 aa16.61■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf56Q8N813 242 aa16.61■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 H3BMG7 143 aa16.6■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 APOC4P55056 127 aa16.6■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.6■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 GP9P14770 177 aa16.6■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 CFHR4Q92496 578 aa16.6■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 MAJINQ3KP22 176 aa16.59■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.59■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.59■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 K7ERJ3 54 aa16.58■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 FOXE3Q13461 319 aa16.58■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CCSAP-201ENST00000284617 NXPH4O95158 308 aa16.58■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 NKAPP1Q8N9T2 125 aa16.58■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CARD19Q96LW7 228 aa16.58■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 I3L2K1 104 aa16.57■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 GNRH2O43555 120 aa16.57■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 NPBQ8NG41 125 aa16.57■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.57■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.57■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 F6UB75 175 aa16.56■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-17P01599 117 aa16.56■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.56■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 K7EIM0 57 aa16.56■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB125Q8N687 156 aa16.55■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.55■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 NOTCH4Q99466 2003 aa16.55■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CFC1BP0CG36 223 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CFC1P0CG37 223 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 AMTNQ6UX39 209 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM126AQ9H061 195 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 PATE2Q6UY27 113 aa16.54■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CRLF1O75462 422 aa16.53■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 PCP2Q8IVA1 136 aa16.53■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 IFITM1P13164 125 aa16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 RPL32P62910 135 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 SPRNQ5BIV9 151 aa16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.52■□□□□ 0.24
CCSAP-201ENST00000284617 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.52■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS33Q8NF86 280 aa16.52■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 MED13Q9UHV7 2174 aa16.52■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 HAMPP81172 84 aa16.52■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 NBL1P41271 181 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01545Q5VT33 79 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 DKK4Q9UBT3 224 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBPL1Q8WX77 278 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.51■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 U3KQE9 123 aa16.5■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 CTSGP08311 255 aa16.5■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 DSCR8Q96T75 97 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-59P01825 116 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 RMI2Q96E14 147 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 WT1P19544 449 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 IGHG4P01861 327 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 RNF152Q8N8N0 203 aa16.49■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 HERV-K104P63124 156 aa16.48■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.48■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS47A8MTI9 375 aa16.48■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 NUPR1O60356 82 aa16.48■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 CCL25O15444 150 aa16.47■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 BUB3O43684 328 aa16.47■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 GRNP28799 593 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.47■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 Q9H8V8 135 aa16.47■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD29Q8N6D5 301 aa16.46■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.46■□□□□ 0.23
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV25A0A0B4J276 109 aa16.45■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms