RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 ATP6V0E1O15342 81 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV1-69P01742 117 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 F5H768 121 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-201ENST00000273317 A0A0G2JRQ6 117 aa6.37□□□□□ -1.39
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LIMD1-201ENST00000273317 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.37□□□□□ -1.39
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LIMD1-201ENST00000273317 IGHG2P01859 326 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 H0YGX0 51 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 J3KT08 172 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 CFC1BP0CG36 223 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 CFC1P0CG37 223 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 RNF144BQ7Z419 303 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-201ENST00000273317 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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