RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GXF2 115 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A8MTW9 85 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRZBQ92765 325 aa15.03■□□□□ -0
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KNCNA6PVL3 124 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNURFLB1AK76 121 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPOP30536 169 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C19orf73Q9NVV2 129 aa15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV3-20P01619 116 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLC6P0CF74 106 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMTNQ6UX39 209 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF575Q86XF7 245 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GUT8 65 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BMM0 161 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DQA1P01909 254 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRGC1P0CF51 173 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HBBP68871 147 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIR3DS1Q14943 382 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZQT7 251 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q8N1Y9 231 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BORCS7Q96B45 105 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BKO60814 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BJP06899 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BOP23527 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BBP33778 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTRLP40313 264 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDKN1BP46527 198 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BDP58876 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB4BP61018 213 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BCP62807 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST2H2BEQ16778 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BHQ93079 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BNQ99877 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIST1H2BMQ99879 126 aa15□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C7orf71A4D174 169 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR11H12B2RN74 326 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIGQ13278 110 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DEFB125Q8N687 156 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TPPP3Q9BW30 176 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMPP49913 170 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GW15 77 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAGKQ9UJ70 344 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R2Z0 102 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S100A8P05109 93 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S100A6P06703 90 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLUHP3Q96NS8 147 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F2Z2F3 143 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GATD1Q8NB37 220 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNFNQ9BYD5 112 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APCSP02743 223 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MUC21Q5SSG8 566 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNS1Q96KK3 526 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 K7EIL1 84 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNLZQ5SXM8 178 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAI2O43623 268 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR5AL1P0C617 328 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASIPP42127 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFA6P56556 154 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLAQ13239 276 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STHQ8IWL8 128 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MED14OSP0DP75 135 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FXYD7P58549 80 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C5orf52A6NGY3 159 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRG1Q3Y452 100 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BVH4 76 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms