RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.35■□□□□ 0.21
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ODC1-201ENST00000234111 SCGB1C2P0DMR2 95 aa16.35■□□□□ 0.21
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ODC1-201ENST00000234111 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.28■□□□□ 0.2
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ODC1-201ENST00000234111 C11orf86A6NJI1 115 aa16.24■□□□□ 0.19
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ODC1-201ENST00000234111 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.23■□□□□ 0.19
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ODC1-201ENST00000234111 KAAG1Q9UBP8 84 aa16.22■□□□□ 0.19
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ODC1-201ENST00000234111 AKAP13Q12802 2813 aa16.21■□□□□ 0.19
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ODC1-201ENST00000234111 WNK2Q9Y3S1 2297 aa16.21■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.21■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 ODF3Q96PU9 254 aa16.21■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.2■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 M0R381 172 aa16.2■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.2■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa16.19■□□□□ 0.18
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