RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 KLF12Q9Y4X4 402 aa10.8□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF266Q14584 549 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 Q8TAT8 98 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 TMED6Q8WW62 240 aa10.79□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 MUC4Q99102 2169 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PPV4 95 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 DIRC3C9JPN6 131 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF415Q09FC8 603 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 SLAQ13239 276 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ESRGQ1W209 222 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 WFDC1Q9HC57 220 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 OTORQ9NRC9 128 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A1W2PPQ1 181 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 ALG5Q9Y673 324 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A096LPF7 62 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PGPA6NDG6 321 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PTTG1O95997 202 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 BTF3P20290 206 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TNP2Q05952 138 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 Q6AWC8 147 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 Q6ZQT7 251 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 HYLS1Q96M11 299 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TRGV11A0A075B6L2 103 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PAX4O43316 350 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PRO0255Q9UI72 69 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB2AP61019 212 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 RGS21Q2M5E4 152 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MUC21Q5SSG8 566 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 SPXQ9BT56 116 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MED28Q9H204 178 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.74□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 RYR1P21817 5038 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 IGHV3-53P01767 116 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TDRG1Q3Y452 100 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 ASB13Q8WXK3 278 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 AQP10Q96PS8 301 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MBP02144 154 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF575Q86XF7 245 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 RASL10AQ92737 203 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MDFICQ9P1T7 246 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 STAG3L2P0CL84 134 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 STAG3L3P0CL85 134 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 CRYBA4P53673 196 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 SERF2P84101 59 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 FHL2Q14192 279 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRVP-204ENST00000639439 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 C16orf90A8MZG2 172 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 C8orf49Q96NF6 230 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 TREM1Q9NP99 234 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 NAGKQ9UJ70 344 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 SIVA1O15304 175 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP6V0CP27449 155 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 SUN5Q8TC36 379 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 RAB24Q969Q5 203 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNS1Q96KK3 526 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 K7EQM0 130 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 NXPH4O95158 308 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 GNG5P63218 68 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRVP-204ENST00000639439 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms