RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 RGS13O14921 159 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RAB2AP61019 212 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ZNF415Q09FC8 603 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RGS21Q2M5E4 152 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PRR9Q5T870 116 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PKD1P98161 4303 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GAGE12BA1L429 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RNF222A6NCQ9 220 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 J3KRW8 73 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RTL8CO15255 209 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GAGE7O76087 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GAGE12FP0CL80 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GAGE12GP0CL81 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GAGE12IP0CL82 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ATP6V0CP27449 155 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZTI0 123 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 SPXQ9BT56 116 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PPQ1 181 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PGPA6NDG6 321 aa6.31□□□□□ -1.4
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PKP4-218ENST00000629219 NUDT3O95989 172 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 CXorf1O96002 111 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.31□□□□□ -1.4
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PKP4-218ENST00000629219 TTC32Q5I0X7 151 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 Q8TAT8 98 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RASL10AQ92737 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 A0A1W2PRE2 83 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 G3V3Q6 166 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 K7EQM0 130 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GCHFRP30047 84 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 OR5I1Q13606 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 Q5BKY6 102 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RAB24Q969Q5 203 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 KCNS1Q96KK3 526 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PRO0255Q9UI72 69 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 CIDEAO60543 219 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TCRAP04437 139 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ZNF345Q14585 488 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 SSX7Q7RTT5 188 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 PTH2Q96A98 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 HYLS1Q96M11 299 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 A0A096LPF7 62 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 K7EP13 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 M0R2N4 97 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 C6orf223Q8N319 242 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 Q9H8V8 135 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TREM1Q9NP99 234 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-218ENST00000629219 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 GGTLC3B5MD39 225 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 M0R2P5 195 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 CRYBA4P53673 196 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 FHL2Q14192 279 aa6.27□□□□□ -1.41
PKP4-218ENST00000629219 ESRGQ1W209 222 aa6.27□□□□□ -1.41
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