RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SHISA9B4DS77 424 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TM4SF5O14894 197 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SH2D1AO60880 128 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC01560Q8TB33 94 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CECR9P0C854 216 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 GP9P14770 177 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 HES1Q14469 280 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CRLF1O75462 422 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV4-39P01824 125 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZQT7 251 aa7.13□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 PLNP26678 52 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 GAS8-AS1O95177 125 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGHG3P01860 377 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8TAT8 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CCL13Q99616 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A16P16260 332 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 GLRXP35754 106 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CRIP1P50238 77 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 LAGE3Q14657 143 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF56Q15929 161 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 PIFOQ8TCI5 191 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 PTPN13Q12923 2485 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 H7C1H1 209 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CD40P25942 277 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ASIPP42127 132 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 POU2AF1Q16633 256 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TRGV9Q99603 122 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A087WX48 190 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 SRD5A1P18405 259 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TIMD4Q96H15 378 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 HERVK_113P61574 105 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV2-11P01706 119 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.1□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1W2PPI3 338 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CREBBPQ92793 2442 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 F8VRH5 84 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 U3KQK5 164 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-210ENST00000625282 ZMAT4Q9H898 229 aa7.09□□□□□ -1.27
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SPTAN1-210ENST00000625282 LINC01559Q495D7 138 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 SRRM5B3KS81 715 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 BSPH1Q075Z2 132 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 C5orf47Q569G3 176 aa7.08□□□□□ -1.28
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SPTAN1-210ENST00000625282 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.282e-6■■■□□ 18.9
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A0G2JNJ9 132 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 FSTL3O95633 263 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM126AQ9H061 195 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 Q9UFV3 132 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8N1Y9 231 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-210ENST00000625282 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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