RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 MRAPQ8TCY5 172 aa6.61□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE7O76087 117 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE12FP0CL80 117 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE12GP0CL81 117 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE12IP0CL82 117 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 CGB7P0DN87 165 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 I3L3M4 83 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 NPYP01303 97 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 J3QLI3 93 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 K7EM74 188 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 PATE2Q6UY27 113 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 PIP4P1Q86T03 277 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.6□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 C9orf118A6NHY6 69 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 SHISA9B4DS77 424 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE6Q13070 117 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 CR1LQ2VPA4 569 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 RMI2Q96E14 147 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 DKK4Q9UBT3 224 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 PTPRSQ13332 1948 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 A0A096LPF7 62 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 C22orf46C9J442 243 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 G3V318 75 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM126AQ9H061 195 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 PRSS33Q8NF86 280 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 SPRY4Q9C004 299 aa6.59□□□□□ -1.35
ALMS1-208ENST00000620466 P0C879 139 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 GP9P14770 177 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.59□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 Q6ZVH6 145 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM141Q96I45 108 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 IGLV2-23P01705 113 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 YPEL4Q96NS1 127 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 HLA-DMBP28068 263 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.58□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 PFN2P35080 140 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TMEM243Q9BU79 118 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 I3L2K1 104 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 K7EP34 96 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 NDUFS7O75251 213 aa6.57□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 KNTC1P50748 2209 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 WISP2O76076 250 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 DKK2Q9UBU2 259 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 NDUFA4O00483 81 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TCF15Q12870 199 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF747Q9BV97 191 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 MSMPQ1L6U9 139 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 RHODO00212 210 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 E7EUB6 86 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.56□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 CFHR4Q92496 578 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 GTSF1Q8WW33 167 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 CEND1Q8N111 149 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 PI4KAP42356 2102 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 GAGE2BQ13066 116 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.55□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 K7ERJ3 54 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 CDKN1BP46527 198 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF503Q96F45 646 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 A0A1W2PPM0 123 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 C9JAW5 83 aa6.54□□□□□ -1.36
ALMS1-208ENST00000620466 H3BMM0 161 aa6.54□□□□□ -1.36
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