RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 ACY3Q96HD9 319 aa4.77□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ODF3Q96PU9 254 aa4.77□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TMEM222Q9H0R3 208 aa4.77□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 VCXQ9H320 206 aa4.77□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.77□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 HLA-DMAP28067 261 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TSPAN5P62079 268 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IL18Q14116 193 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RSG1Q9BU20 258 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SSR3Q9UNL2 185 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.76□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZFP92A6NM28 416 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 H3BRN7 92 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SPINK4O60575 86 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 OR5AC1P0C628 307 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CXCL2P19875 107 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TBPP20226 339 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 AQP4P55087 323 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PLP1P60201 277 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 LYZP61626 148 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SLAQ13239 276 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 OR2F1Q13607 317 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PSG3Q16557 428 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 GPR107Q5VW38 600 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 Q6ZTI0 123 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 Q8N377 158 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IL22RA2Q969J5 263 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RBKSQ9H477 322 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.75□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CRYBA4P53673 196 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SP6Q3SY56 376 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TDRG1Q3Y452 100 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SCXQ7RTU7 201 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RNF182Q8N6D2 247 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 VGLL1Q99990 258 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PRO0255Q9UI72 69 aa4.74□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 GABARAPH6UMI1 98 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PITX3O75364 302 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 GABARAPO95166 117 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IGLV2-8P01709 118 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 EVI2AP22794 236 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 S100A7P31151 101 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 MXD1Q05195 221 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 LGI3Q8N145 548 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZNF738Q8NE65 137 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TERB2Q8NHR7 220 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SLC35E1Q96K37 410 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.73□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 K7EPK0 472 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 APOA1P02647 267 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 PGAM2P15259 253 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 TCL1AP56279 114 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 OR1S1Q8NH92 325 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 DTD1Q8TEA8 209 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RASL10AQ92737 203 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 NAA60Q9H7X0 242 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 COPZ2Q9P299 210 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 FUT9Q9Y231 359 aa4.72□□□□□ -1.65
SENP3-210ENST00000619785 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms