RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 SPXQ9BT56 116 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 TM2D2Q9BX73 214 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 PYYP10082 97 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF846Q147U1 533 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 C7orf66A4D0T2 115 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 LECT2O14960 151 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF138P52744 262 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 LAGE3Q14657 143 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 LINC01620Q4KN68 170 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 PYDC2Q56P42 97 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 Q8TAT8 98 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 TDRG1Q3Y452 100 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF266Q14584 549 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 RNF213Q63HN8 5207 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 L7N2F9 121 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 CST7O76096 145 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 BCAP31P51572 246 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 VAMP2P63027 116 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 ASAH1Q13510 395 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 M0R2P5 195 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 BAK1Q16611 211 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 LELP1Q5T871 98 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 Q6AWC8 147 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.9□□□□□ -0.5
UBE2C-208ENST00000617055 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 RS1O15537 224 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFB6O95139 128 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 CAV2P51636 162 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 BAXQ07812 192 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 VWC2Q2TAL6 325 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 NAGKQ9UJ70 344 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 V9GYH0 126 aa11.89□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 LRP2P98164 4655 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 BAALCQ8WXS3 180 aa11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV2-8P01709 118 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 TMBIM6P55061 237 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 Q8N3U1 123 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.87□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 RBAKDNA6NC62 111 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 GNRH2O43555 120 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 FGF7P21781 194 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 CSN1S1P47710 185 aa11.85□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 RHOHQ15669 191 aa11.85□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.85□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 MITD1Q8WV92 249 aa11.85□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.85□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 OR10J4P0C629 311 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 S100A11P31949 105 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 TOR2AQ5JU69 321 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 Q8N976 141 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 FXYD5Q96DB9 178 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 OR51M1Q9H341 326 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.84□□□□□ -0.51
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.83□□□□□ -0.52
UBE2C-208ENST00000617055 CCSO14618 274 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms