RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 CRISP2P16562 243 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 TCL1AP56279 114 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 LINC00315P59091 139 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 TAS2R45P59539 299 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ICAM4Q14773 271 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 KHDC3LQ587J8 217 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PRR9Q5T870 116 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 Q8N1X5 172 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ASB13Q8WXK3 278 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 WFDC1Q9HC57 220 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 HERC1Q15751 4861 aa7.01□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 SPINK4O60575 86 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 NMBP08949 121 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF266Q14584 549 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM78Q5T7P6 136 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 FAM122CQ6P4D5 195 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 Q6ZQT7 251 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 AQP10Q96PS8 301 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 VGLL1Q99990 258 aa7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 SIVA1O15304 175 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PAX4O43316 350 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF492Q9P255 531 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.99□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1W2PPV4 95 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 RGS13O14921 159 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 NXPH4O95158 308 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 IGHV3-53P01767 116 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 CSN1S1P47710 185 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 RAB2AP61019 212 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 RANP62826 216 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 Q8TAT8 98 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PRO0255Q9UI72 69 aa6.98□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 RBAKDNA6NC62 111 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF138P52744 262 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 CRYBA4P53673 196 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 Q5BKY6 102 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
MFGE8-216ENST00000613965 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 RNF222A6NCQ9 220 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ATP6V0CP27449 155 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF415Q09FC8 603 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SLAQ13239 276 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 FHL2Q14192 279 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 C8orf49Q96NF6 230 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 OTORQ9NRC9 128 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MYCBP2O75592 4640 aa6.96□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MBP02144 154 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.39e-9■□□□□ 9
MFGE8-216ENST00000613965 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MUC21Q5SSG8 566 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 Q6ZNX1 250 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 HYLS1Q96M11 299 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 MDFICQ9P1T7 246 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.95□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 PGPA6NDG6 321 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 DIRC3C9JPN6 131 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 SFTA3P0C7M3 94 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 STAG3L2P0CL84 134 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-216ENST00000613965 STAG3L3P0CL85 134 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.8 ms