RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.04□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGF1P05019 195 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCTAP57738 103 aa9.04□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.04□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa9.03□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL3P36405 182 aa9.03□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB9AP51151 201 aa9.03□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.03□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.03□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.03□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.03□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U3KQK5 164 aa9.03□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PET117Q6UWS5 81 aa9.02□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf92Q96LL3 132 aa9.02□□□□□ -0.96
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf173Q96LM9 149 aa9.02□□□□□ -0.96
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.02□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 U3KQE9 123 aa9.02□□□□□ -0.97
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF185Q96GF1 192 aa9.01□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.01□□□□□ -0.97
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PF4V1P10720 104 aa9.01□□□□□ -0.97
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCP4P48539 62 aa9.01□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRD5A1P18405 259 aa8.99□□□□□ -0.97
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNFNQ9BYD5 112 aa8.99□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHG2P01859 326 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NDX4 124 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCF21O43680 179 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNG7P62955 275 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR3DS1Q14943 382 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TM4SF20Q53R12 229 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERASQ7Z444 233 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT3O95989 172 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.98□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF6BO95407 300 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HBDP02042 147 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFS8O00217 210 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BVH4 76 aa8.96□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.96□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.96□□□□□ -0.97
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA4O00483 81 aa8.96□□□□□ -0.98
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.96□□□□□ -0.98
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.96□□□□□ -0.98
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