RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.76□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 A0A0D9SG52 128 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 A0A1W2PRE2 83 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 CBY3A6NI87 242 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 IGLV2-11P01706 119 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TCRAP04437 139 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 SEC11BP0C7V7 166 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 HTN1P15515 57 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 Q6ZQT7 251 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 HYLS1Q96M11 299 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 ATP5G1P05496 136 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 DEFB130BP0DP73 79 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 DEFB130AP0DP74 79 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 ATP5G3P48201 142 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TCL1AP56279 114 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 GNG5P63218 68 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TDRG1Q3Y452 100 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 STOML3Q8TAV4 291 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TVP23CQ96ET8 276 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 SNURFLB1AK76 121 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 UMAD1C9J7I0 102 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 SPINK4O60575 86 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 FHITP49789 147 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 ATG101Q9BSB4 218 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 EPDR1Q9UM22 224 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 FAM74A7A6NL05 159 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 P0DMU3 169 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 FAM231AP0DMU4 169 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 FAM231CP0DMU5 169 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 Q6ZTI0 123 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TMUB2Q71RG4 321 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC00649-212ENST00000601471 K7EQM0 130 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 RGS13O14921 159 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 C1QBP02746 253 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 HTN3P15516 51 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 HOXA5P20719 270 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 TREM1Q9NP99 234 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE12BA1L429 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 H3BNG1 76 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE7O76087 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE12FP0CL80 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE12GP0CL81 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE12IP0CL82 117 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 RNF212Q495C1 297 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 PSG8Q9UQ74 426 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 MUC4Q99102 2169 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 NACAE9PAV3 2078 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 F5H768 121 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 F6UZH7 168 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 PEX7O00628 323 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 PFDN1O60925 122 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms