RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF224P0DH78 156 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPOP30536 169 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 CKS2P33552 79 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNG7P62955 275 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMG4Q5JS54 123 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM219Q86XT9 240 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF580Q9UK33 172 aa7.08□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ATRXP46100 2492 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LAMA5O15230 3695 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM213A2RRL7 107 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 OVOL1O14753 267 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHG4P01861 327 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE1Q13065 139 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01545Q5VT33 79 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 AMN1Q8IY45 258 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZZEF1O43149 2961 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ATMQ13315 3056 aa7.07□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NDX4 124 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 B4DSR2 109 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHG2P01859 326 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLL1P15814 213 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A16P16260 332 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 HLA-DMBP28068 263 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF182Q8N6D2 247 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF738Q8NE65 137 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 GLMPQ8WWB7 406 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 DPF1Q92782 380 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF747Q9BV97 191 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.06□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BUX3 64 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QLI3 93 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF21O43680 179 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ERCC8Q13216 396 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR31Q5SQ13 230 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00477Q96M19 166 aa7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01548A6NM66 108 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAC2D3DTV9 90 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 H0Y8G0 127 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 J3QKU1 62 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PIFOQ8TCI5 191 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA4P78363 2273 aa7.04□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM89A2RUT3 159 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01546A6NGU7 62 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 DLEU1O43261 78 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 NPYP01303 97 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G2AP14555 144 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 G0S2P27469 103 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-2P60368 255 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 LY6EQ16553 131 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 MAJINQ3KP22 176 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.03□□□□□ -1.28
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 hDV102S1A0JD36 115 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 SNAI2O43623 268 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 ID1P41134 155 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.02□□□□□ -1.29
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms