RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB31Q13636 194 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 LEMD1Q68G75 181 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR82Q96P67 336 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 RSG1Q9BU20 258 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087X002 238 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SIX6O95475 246 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF688P0C7X2 276 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 GALR1P47211 349 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CAV2P51636 162 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CASC10Q5T4H9 136 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00052Q96N35 136 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 NMES1Q9C002 83 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 COL7A1Q02388 2944 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 KNCNA6PVL3 124 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 AGPAT2O15120 278 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SSNA1O43805 119 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CST7O76096 145 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV2-30P06310 120 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5G3P0C626 314 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 MEOX2P50222 304 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SULT1A1P50225 295 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2G2P60604 165 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 S100A10P60903 97 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 HBG1P69891 147 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 HBG2P69892 147 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMG4Q5JS54 123 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL6Q9H0F7 186 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BMM0 161 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ISLRO14498 428 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 OXTP01178 125 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00869P0C866 280 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB4AP20338 218 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 CLINT1Q14677 625 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 DEFB135Q30KP9 77 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 PATE2Q6UY27 113 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 STX12Q86Y82 276 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 Q8NBF4 154 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 OR11H2Q8NH07 326 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ARV1Q9H2C2 271 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A22Q9H936 323 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB5AP20339 215 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMB3P49720 205 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS21Q2M5E4 152 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf223Q8N319 242 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RPRMQ9NS64 109 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 DOK5Q9P104 306 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 TENM3Q9P273 2699 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0J9YWU9 116 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 IGSF23A1L1A6 192 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BRN7 92 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 SOCS3O14543 225 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MPC2O95563 127 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV2-11P01706 119 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DRB4P13762 266 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF726P1Q15940 193 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR4Q16378 134 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MIC13Q5XKP0 118 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 MGST2Q99735 147 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 NAGKQ9UJ70 344 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 COX7A2P2O60397 106 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-216ENST00000590105 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms