RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 A0A0J9YXV3 536 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 I3L2K1 104 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 MT-CO2P00403 227 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 UCHL1P09936 223 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 M6PRP20645 277 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PSMB3P49720 205 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ATP6V1FQ16864 119 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 XAF1Q6GPH4 301 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 COQ8AQ8NI60 647 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM203Q969S6 136 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 MND1Q9BWT6 205 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ENY2Q9NPA8 101 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SULT1C2O00338 296 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 ISLRO14498 428 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 GCGP01275 180 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A4P12235 298 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 GNG2P59768 71 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 CACNG7P62955 275 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SLAQ13239 276 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 HACD4Q5VWC8 232 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 S100A7AQ86SG5 101 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR4X1Q8NH49 305 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPRMQ9NS64 109 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GVX0 72 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 MFNGO00587 321 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 KRASP01116 189 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 APOA1P02647 267 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB130BP0DP73 79 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRM-208ENST00000578600 EVI2AP22794 236 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR10A3P58181 314 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00315P59091 139 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R60P59551 318 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 GNGT1P63211 74 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 PRCDQ00LT1 54 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 SMUG1Q53HV7 270 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-208ENST00000578600 V9GYY9 64 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRM-208ENST00000578600 A6NJ64 397 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF98A6NK75 572 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 J3QRK9 145 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PSCAO43653 123 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 PPYP01298 95 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 OPRK1P41145 380 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 VAMP3Q15836 100 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 CDNFQ49AH0 187 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35G3Q8N808 338 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 OR51H1Q8NH63 302 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 CYYR1Q96J86 154 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00052Q96N35 136 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 GPR82Q96P67 336 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-208ENST00000578600 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.4□□□□□ -1.87
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