RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00479Q96M42 142 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYGO2Q9BRQ0 406 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TREM1Q9NP99 234 aa23.82■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf94C9JXX5 98 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRM2P04554 102 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTN1P15515 57 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNA1P01562 189 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRNTQ86SH4 94 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXNDC17Q9BRA2 123 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV34A0A0B4J273 112 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX261Q6UWH6 196 aa23.79■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6AWC8 147 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf45Q8TAV5 145 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 AZU1P20160 251 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMP1P54849 157 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYPD6BQ8NI32 183 aa23.77■■□□□ 1.4
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF493Q6ZR52 646 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf74Q96GX8 76 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 FMC1Q96HJ9 113 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00467Q9BRT7 94 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF12Q9Y4X4 402 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH7Q8WXX0 4024 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBE2G1P62253 170 aa23.75■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1C3P42330 323 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZQT7 251 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q86TA4 180 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCO2A0A1W2PP80 73 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2P10415 239 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf49Q96NF6 230 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf84H3BNL1 204 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM183BQ1AE95 376 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF680Q8NEM1 530 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2CD4CQ8TF44 421 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELA1Q9UNI1 258 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf65A6NEN9 183 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS13O14921 159 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV21A0A0B4J279 112 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAC8L1A1L4L8 177 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPART-AS1P0CW21 52 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMUG1Q53HV7 270 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAX2Q9UIW0 290 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP30Q9Y2G7 519 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A9P06702 114 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DKK2Q9UBU2 259 aa23.7■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM222AQ5U5X8 452 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf52Q96A22 123 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBY3A6NI87 242 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE6DO43924 150 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCGP01275 180 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 LTAP01374 205 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM159AQ6UWV7 190 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFN1P07737 140 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUC21Q5SSG8 566 aa23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYRM9A8MSI8 78 aa23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFAND6Q6FIF0 208 aa23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDRG1Q3Y452 100 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX8CQ7Z4L0 72 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSMD3Q7Z407 3707 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf74Q32Q52 190 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASC10Q5T4H9 136 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf72Q8NBR9 251 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAGKQ9UJ70 344 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBFOX3A6NFN3 312 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNURFLB1AK76 121 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL35P42766 123 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM183AQ8IXX5 376 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZTC4 211 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 DERL1Q9BUN8 251 aa23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF767PQ75MW2 155 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNS1Q96KK3 526 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED9Q9NWA0 146 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRGV11A0A075B6L2 103 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUPR2A6NF83 97 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 FABP5P3A8MUU1 101 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCL1AP56279 114 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF506Q5JVG8 444 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAGE2Q86Y30 109 aa23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAD1P61803 113 aa23.58■■□□□ 1.36
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDF2L1Q9HCN8 221 aa23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms