RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 CST7O76096 145 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BCAP31P51572 246 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 V9GYH0 126 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 L7N2F9 121 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 LECT2O14960 151 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 VAMP2P63027 116 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 BAXQ07812 192 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 PDE6HQ13956 83 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF138P52744 262 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01620Q4KN68 170 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SCXQ7RTU7 201 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 RASL10AQ92737 203 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CCSO14618 274 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 CAV2P51636 162 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFB6O95139 128 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 RPL29P47914 159 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TMBIM6P55061 237 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF846Q147U1 533 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SPXQ9BT56 116 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NAGKQ9UJ70 344 aa11.6□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 H3BMQ9 156 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 TIRAPP58753 221 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC40-211ENST00000574099 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 OXTP01178 125 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FGF7P21781 194 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF266Q14584 549 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.58□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 BAK1Q16611 211 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 VWC2Q2TAL6 325 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 Q8N3U1 123 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TM2D2Q9BX73 214 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FAM25EA8MYX2 175 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 M0R2P5 195 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 OR10J4P0C629 311 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 INPP1P49441 399 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 Q6AWC8 147 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 MITD1Q8WV92 249 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 IGSF23A1L1A6 192 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 GNRH2O43555 120 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 LAGE3Q14657 143 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 LELP1Q5T871 98 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 OR51M1Q9H341 326 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 S100A5P33763 92 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 CSN1S1P47710 185 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 BAALCQ8WXS3 180 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 FXYD5Q96DB9 178 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 S100A11P31949 105 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SULT1A1P50225 295 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 S100A10P60903 97 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TRIQKQ629K1 86 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PAXXQ9BUH6 204 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RBAKDNA6NC62 111 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 C5orf51A6NDU8 294 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TYMSP04818 313 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms