RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 GAGE12BA1L429 117 aa13.99□□□□□ -0.17
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CMTM3-211ENST00000565922 GAGE12FP0CL80 117 aa13.99□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 GAGE12GP0CL81 117 aa13.99□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 GAGE12IP0CL82 117 aa13.99□□□□□ -0.17
CMTM3-211ENST00000565922 RNF212Q495C1 297 aa13.99□□□□□ -0.17
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CMTM3-211ENST00000565922 SPINK4O60575 86 aa13.94□□□□□ -0.18
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CMTM3-211ENST00000565922 SSX7Q7RTT5 188 aa13.94□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.94□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.93□□□□□ -0.18
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CMTM3-211ENST00000565922 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.93□□□□□ -0.18
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CMTM3-211ENST00000565922 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.9□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.9□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 KCNS1Q96KK3 526 aa13.9□□□□□ -0.18
CMTM3-211ENST00000565922 SPXQ9BT56 116 aa13.9□□□□□ -0.18
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CMTM3-211ENST00000565922 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.9□□□□□ -0.18
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CMTM3-211ENST00000565922 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.89□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.88□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 SGK494Q96LW2 274 aa13.88□□□□□ -0.19
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CMTM3-211ENST00000565922 SMUG1Q53HV7 270 aa13.87□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 PRNTQ86SH4 94 aa13.87□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.87□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 MDFICQ9P1T7 246 aa13.87□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 FAM74A7A6NL05 159 aa13.86□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.86□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.86□□□□□ -0.19
CMTM3-211ENST00000565922 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.86□□□□□ -0.19
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