RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.38□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM189A5PLL7 270 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNURFLB1AK76 121 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 K7EQG2 157 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00477Q96M19 166 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.37□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAB4BP61018 213 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMG4Q5JS54 123 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.36□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 J3KRW8 73 aa13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.35□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM231BA6NCW3 169 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 C5orf52A6NGY3 159 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 ORM1P02763 201 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAFAH1B2P68402 229 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR73Q6P4I2 378 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD33P20138 364 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMPP49913 170 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR9Q5T870 116 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 TPPP3Q9BW30 176 aa13.34□□□□□ -0.27
USP3-AS1-208ENST00000560962 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.33□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZQT7 251 aa13.33□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.33□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 COX19Q49B96 90 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GXF2 115 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 XKRY2A2RUG3 117 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR31Q5SQ13 230 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 SORL1Q92673 2214 aa13.32□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.31□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLA-DQA1P01909 254 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 MT-ND6P03923 174 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 HBBP68871 147 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA1644Q3SXP7 199 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASL11AQ6T310 242 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF575Q86XF7 245 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.3□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIR3DS1Q14943 382 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC01559Q495D7 138 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0J9YX75 114 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBE2CO00762 179 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV3-20P01619 116 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPX1P07203 203 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSTP61278 116 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 EBLN2Q6P2I7 272 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.29□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1B0GUT8 65 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 APCSP02743 223 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXA5P20719 270 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 MUC21Q5SSG8 566 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CITED1Q99966 193 aa13.28□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB131AP59861 70 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLAQ13239 276 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6AWC8 147 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGRNO00468 2067 aa13.27□□□□□ -0.28
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRISP2P16562 243 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIGQ13278 110 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKR1D1P51857 326 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDZD11Q5EBL8 140 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 BORCS7Q96B45 105 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAGKQ9UJ70 344 aa13.26□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 KNCNA6PVL3 124 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGLC6P0CF74 106 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 PF4P02776 101 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.25□□□□□ -0.29
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms