RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ERC2-IT1	O76042	136 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IFITM1	P13164	125 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SSR2	P43308	183 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF846	Q147U1	533 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PYDC2	Q56P42	97 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T2	Q6IF00	324 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf82	Q6UX34	121 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZS92	163 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	AQP10	Q96PS8	301 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP205	Q92621	2012 aa		1.52	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DAPK1	P53355	1430 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R129	80 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	GYPB	P06028	91 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR9	Q5T870	116 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MIC13	Q5XKP0	118 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CASC2	Q6XLA1	102 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		1.51	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH11	P35749	1972 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MED14	O60244	1454 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM262	E9PQX1	116 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB6	O95139	128 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSG	P08311	255 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK8	P0C7L1	97 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL8	P10145	99 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOB	Q15370	118 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SVBP	Q8N300	66 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DISP1	Q96F81	1524 aa		1.5	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf70	A6NJV1	201 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BQ15	152 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV6-57	P01721	117 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		P0C880	135 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ADCYAP1	P18509	176 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	BRS3	P32247	399 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP10-10	P60014	251 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	NPC2	P61916	151 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTSSA	Q969W0	71 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		V9GYS6	101 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		1.49	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	LCT	P09848	1927 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MPC2	O95563	127 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3-33	P01772	117 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IL5	P05113	134 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00315	P59091	139 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957		Q1T7F1	81 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf137	Q5JT78	98 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFL1	Q6UW32	110 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	TSKU	Q8WUA8	353 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		1.48	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		1.47	□□□□□ -2.17
AKAP13-223	ENST00000560957	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		1.47	□□□□□ -2.17

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