RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-211ENST00000555834 GAGE4Q13068 117 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 GAGE5Q13069 117 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 C17orf77Q96MU5 243 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 RHODO00212 210 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 SS18L2Q9UHA2 77 aa13.07□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 B4DSR2 109 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 B5MCH6 92 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 LINC00311Q8N616 119 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 UBL5Q9BZL1 73 aa13.06□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 F8WEM9 126 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 C20orf78Q9BR46 151 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYO7BQ6PIF6 2116 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 DSCR9P59020 149 aa13.05□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 DEFB130BP0DP73 79 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 DEFB130AP0DP74 79 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 XCL2Q9UBD3 114 aa13.04□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 UBE2E1P51965 193 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 HAMPP81172 84 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 U3KQA8 63 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 PI4KAP42356 2102 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 Q6ZS92 163 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 TMEM126AQ9H061 195 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 CFC1BP0CG36 223 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 CFC1P0CG37 223 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 POU2AF1Q16633 256 aa13.03□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGLL5B9A064 214 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 PLXNA2O75051 1894 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 CFHR3Q02985 330 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 GAGE6Q13070 117 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.02□□□□□ -0.32
RPS6KL1-211ENST00000555834 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.02□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.02□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 CRYBA4P53673 196 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ACACAQ13085 2346 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGHG4P01861 327 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 Q8NFD4 153 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 CFHR4Q92496 578 aa13.01□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 LINC01545Q5VT33 79 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 DYNAPQ8N1N2 210 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 NDUFA4O00483 81 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 CDK2AP2O75956 126 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 NXPH4O95158 308 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 RS1O15537 224 aa13□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 CRLF1O75462 422 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 MRAPQ8TCY5 172 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.99□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF407Q9C0G0 2248 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 K7EMI3 77 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 TMEM243Q9BU79 118 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGLV1-44P01699 117 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.98□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 TAX1BP3O14907 124 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXE3Q13461 319 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 GNLYP22749 145 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 HERVK_113P63121 156 aa12.97□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 SSC4DQ8WTU2 575 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 GNRH2O43555 120 aa12.96□□□□□ -0.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms