RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RYR2Q92736 4967 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RBAKDNA6NC62 111 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DEFB4AO15263 64 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PLA2G10O15496 165 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SSNA1O43805 119 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CST7O76096 145 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLC2P0DOY2 106 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 M6PRP20645 277 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FGF7P21781 194 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 BTCP35070 178 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 AMTP48728 403 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 OPCMLQ14982 345 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 KHDC3LQ587J8 217 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 AMTNQ6UX39 209 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 UHRF2Q96PU4 802 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 LYSTQ99698 3801 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1W2PPV4 95 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 F5H768 121 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 M0R2Z0 102 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 GPX1P07203 203 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DEFB130BP0DP73 79 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DEFB130AP0DP74 79 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 IL15RAQ13261 267 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 THAP6Q8TBB0 222 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 MGST2Q99735 147 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 OR51M1Q9H341 326 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 C7orf71A4D174 169 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 F6UB75 175 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 OR7C2O60412 319 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PTTG1O95997 202 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ORM1P02763 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 HTN1P15515 57 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 HTN3P15516 51 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CRISP2P16562 243 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF138P52744 262 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SERF2P84101 59 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FCN2Q15485 313 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PATE2Q6UY27 113 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 NFE4Q86UQ8 179 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF182Q8N6D2 247 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNS1Q96KK3 526 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 SPXQ9BT56 116 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 PAXXQ9BUH6 204 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 CELA1Q9UNI1 258 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FUT9Q9Y231 359 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms