RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 UHRF2Q96PU4 802 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 RPRMQ9NS64 109 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ISLRO14498 428 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 XGP55808 180 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 RND3P61587 244 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SP6Q3SY56 376 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SLC24A4Q8NFF2 622 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 C18orf15Q96N68 181 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CBY3A6NI87 242 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR8G2PQ6IF36 304 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 AMTNQ6UX39 209 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 FAM219AQ8IW50 185 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PRO1933Q9H354 126 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 M0R2Z0 102 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 INSP01308 110 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TYMSP04818 313 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 AZU1P20160 251 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 UCP1P25874 307 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TSPOP30536 169 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR52E5Q8NH55 327 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 C16orf92Q96LL3 132 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CRXO43186 299 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CXCL1P09341 107 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 AARDQ4LEZ3 155 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf173Q96LM9 149 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZFP92A6NM28 416 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 A8MTW9 85 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CNN1P51911 297 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 LYZP61626 148 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF90Q03938 601 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 OR5I1Q13606 314 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ICAM4Q14773 271 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PET117Q6UWS5 81 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 UPK3BQ9BT76 320 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 NAA60Q9H7X0 242 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 MDFICQ9P1T7 246 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 NAT8Q9UHE5 227 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 XKRY2A2RUG3 117 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM250H0YL14 139 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 HTN1P15515 57 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00315P59091 139 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ESRGQ1W209 222 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 CACNG5Q9UF02 275 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0J9YY99 117 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 J3QL48 77 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 EREGO14944 169 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 IFNA5P01569 189 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 VAMP2P63027 116 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SERF2P84101 59 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM183BQ1AE95 376 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 IL22RA2Q969J5 263 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 LINC01587Q99440 93 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 BCL2P10415 239 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 SLC25A6P12236 298 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 TAS2R30P59541 319 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 NMSQ5H8A3 153 aa10□□□□□ -0.81
PTPRB-205ENST00000547715 CDPF1Q6NVV7 123 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms