RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB24Q969Q5 203 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 OTORQ9NRC9 128 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 F5H768 121 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBAKDNA6NC62 111 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 CBY3A6NI87 242 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNURFLB1AK76 121 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP5G1P05496 136 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 STAG3L2P0CL84 134 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 STAG3L3P0CL85 134 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP5G3P48201 142 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNP2Q05952 138 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSX7Q7RTT5 188 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE12BA1L429 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARPC5O15511 151 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE7O76087 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 NMBP08949 121 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE12FP0CL80 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE12GP0CL81 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE12IP0CL82 117 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNG5P63218 68 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERF2P84101 59 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.48□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 MBP02144 154 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GCHFRP30047 84 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00612Q8N6U2 182 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.47□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 NACAE9PAV3 2078 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGS13O14921 159 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q6ZTI0 123 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.46□□□□□ -0.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC21Q5SSG8 566 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.45□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF726P1Q15940 193 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 SGK494Q96LW2 274 aa13.44□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUDT3O95989 172 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 CXorf1O96002 111 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR5I1Q13606 314 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUN5Q8TC36 379 aa13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXA5P20719 270 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 C6orf223Q8N319 242 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TVP23CQ96ET8 276 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.42□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPM2AB3EWF7 344 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 F6UZH7 168 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAAR5O14804 337 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCL1AP56279 114 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q6AWC8 147 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMED6Q8WW62 240 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.41□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0J9YY99 117 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 GGTLC3B5MD39 225 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.4□□□□□ -0.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPINK4O60575 86 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCRAP04437 139 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 TREM1Q9NP99 234 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 MDFICQ9P1T7 246 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAGKQ9UJ70 344 aa13.39□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBE2G2P60604 165 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.38□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.37□□□□□ -0.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF415Q09FC8 603 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms