RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.14□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 RGS13O14921 159 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 NMBP08949 121 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 SERF2P84101 59 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.13□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 GGTLC3B5MD39 225 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 NUDT3O95989 172 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 IQCF2Q8IXL9 164 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0J9YY99 117 aa13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 TCL1AP56279 114 aa13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 OR5I1Q13606 314 aa13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 SUN5Q8TC36 379 aa13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 MBP02144 154 aa13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 MDFICQ9P1T7 246 aa13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 NAGKQ9UJ70 344 aa13.1□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 CXorf1O96002 111 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 Q6AWC8 147 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 C8orf49Q96NF6 230 aa13.09□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 MUC4Q99102 2169 aa13.08□□□□□ -0.31
TSTA3-211ENST00000529899 SPINK4O60575 86 aa13.08□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 IGHV3-53P01767 116 aa13.08□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TCRAP04437 139 aa13.08□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 UBE2G2P60604 165 aa13.08□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ARPC5LQ9BPX5 153 aa13.08□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 IGLV2-11P01706 119 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 FHITP49789 147 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 KCNRGQ8N5I3 272 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TMED6Q8WW62 240 aa13.07□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 LINC00479Q96M42 142 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TREM1Q9NP99 234 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 LENEPQ9Y5L5 61 aa13.06□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TAAR5O14804 337 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 GNRH2O43555 120 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF415Q09FC8 603 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 RNF212Q495C1 297 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 Q6ZR54 194 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ATG101Q9BSB4 218 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 EPDR1Q9UM22 224 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 PSG8Q9UQ74 426 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 DNAH2Q9P225 4427 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 RTL8CO15255 209 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 TYMSP04818 313 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF345Q14585 488 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 PRNTQ86SH4 94 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-211ENST00000529899 SFTA3P0C7M3 94 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 C18orf15Q96N68 181 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 A0A1B0GV50 99 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 A0A1W2PRE2 83 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 FAM74A7A6NL05 159 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 HMSDA8MTL9 139 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 BCL2L11O43521 198 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 GCGP01275 180 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-211ENST00000529899 TDRG1Q3Y452 100 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms