RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.43□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.43□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 HOXB5P09067 269 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 SMIM8Q96KF7 97 aa8.42□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 NDUFB4O95168 129 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 IGLV2-11P01706 119 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 IL7P13232 177 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 VAMP1P23763 118 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 TRIM63Q969Q1 353 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 PRELID1Q9Y255 219 aa8.41□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 DEFA1P59665 94 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 DEFA3P59666 94 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 BAALCQ8WXS3 180 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 MGST2Q99735 147 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 SPXQ9BT56 116 aa8.4□□□□□ -1.06
PUF60-211ENST00000527744 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 SSSCA1O60232 199 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 SFT2D2O95562 160 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ASIPP42127 132 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ARL16Q0P5N6 197 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 BAK1Q16611 211 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 LELP1Q5T871 98 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ZNF492Q9P255 531 aa8.39□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.38□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PPP1R1AQ13522 171 aa8.38□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 MUC21Q5SSG8 566 aa8.38□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.38□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 Q8N3U1 123 aa8.38□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 RNF222A6NCQ9 220 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 LYRM1O43325 122 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PDE6HQ13956 83 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 Q6ZRG5 221 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 Q8N976 141 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 GGACTQ9BVM4 153 aa8.37□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 UPK1BO75841 260 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 CAMLGP49069 296 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ZNF138P52744 262 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 MIC13Q5XKP0 118 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ENKURQ8TC29 256 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.36□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TSC22D2O75157 780 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 NDUFB6O95139 128 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 TAS2R30P59541 319 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ZNF266Q14584 549 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 Q6ZRU5 148 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 Q8TAT8 98 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PFDN5Q99471 154 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 COX11Q9Y6N1 276 aa8.35□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 M0R2P5 195 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PYYP10082 97 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 PAXXQ9BUH6 204 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PUF60-211ENST00000527744 RAB31Q13636 194 aa8.33□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 TOR2AQ5JU69 321 aa8.33□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 Q6AWC8 147 aa8.33□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.33□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 PLA2G10O15496 165 aa8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 TCRBP04435 133 aa8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 RHOHQ15669 191 aa8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.32□□□□□ -1.08
PUF60-211ENST00000527744 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms