RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515143.5

SPOCK3-223, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, human

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCK3-223	ENST00000515143	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A096LPF7	62 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE7	O76087	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	NUDT3	O95989	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GPX1	P07203	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TAS2R45	P59539	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	CLINT1	Q14677	625 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	SPX	Q9BT56	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	IFNA5	P01569	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	CSN1S1	P47710	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	SERF2	P84101	59 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR5I1	Q13606	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	FHL2	Q14192	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRR9	Q5T870	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PTH2	Q96A98	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	CIDEA	O60543	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10J4	P0C629	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	CRYBA4	P53673	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TIRAP	P58753	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q6ZQT7	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	HSPG2	P98160	4391 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PGP	A6NDG6	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	RGS13	O14921	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SSNA1	O43805	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR7C2	O60412	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PTTG1	O95997	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A0J9YY99	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A1W2PPV4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		J3KRW8	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PAX4	O43316	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	MB	P02144	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143		M0R2P5	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	SIVA1	O15304	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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