RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	TMED6	Q8WW62	240 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRE2	83 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148		M0R2N4	97 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	HTN1	P15515	57 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MIB2-223	ENST00000508148	MUC4	Q99102	2169 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	RYR1	P21817	5038 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148		K7EQM0	130 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	GNG5	P63218	68 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	PRM2	P04554	102 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148		P0DMU3	169 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	AZU1	P20160	251 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	CD300C	Q08708	224 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TCRA	P04437	139 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FHIT	P49789	147 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	PRR9	Q5T870	116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2G2	P60604	165 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	DAD1	P61803	113 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GVG6	124 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	CBY3	A6NI87	242 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	RGS13	O14921	159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	IFNA7	P01567	189 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	RAB5C	P51148	216 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148		Q6AWC8	147 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZR54	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	PEX7	O00628	323 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	PPT1	P50897	306 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148		F6UZH7	168 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	SULT1A2	P50226	295 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GV50	99 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	HTN3	P15516	51 aa		11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MIB2-223	ENST00000508148	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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