RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00477Q96M19 166 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 MLST8Q9BVC4 326 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 BIN3Q9NQY0 253 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.2□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF727A8MUV8 499 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 G3V4G9 280 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 AMBPP02760 352 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 CD7P09564 240 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF138P52744 262 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 CENPWQ5EE01 88 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PRNTQ86SH4 94 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PSG8Q9UQ74 426 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.19□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KNCNA6PVL3 124 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PRAC2D3DTV9 90 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 F6UB75 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 F8W036 122 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 LTAP01374 205 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP10-2P60368 255 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 Q8TAT8 98 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PRR25Q96S07 402 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 DERL1Q9BUN8 251 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TUBA4BQ9H853 241 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF492Q9P255 531 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM218A2RU14 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 H3BMM0 161 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 CDKN1BP46527 198 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 APOC4P55056 127 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SMUG1Q53HV7 270 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 BAGE2Q86Y30 109 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 VGLL1Q99990 258 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SEC11CQ9BY50 192 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 NAT8Q9UHE5 227 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 DNHD1Q96M86 4753 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 A8MTW9 85 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 INSP01308 110 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV3-20P01619 116 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV2-11P01706 119 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 CRISP2P16562 243 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ERCC8Q13216 396 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB125Q8N687 156 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SORL1Q92673 2214 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 C9JQL5 133 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 GPX1P07203 203 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB1P60022 68 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 ADIRFQ15847 76 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 SGK494Q96LW2 274 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00479Q96M42 142 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-211ENST00000497210 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf71A4D174 169 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP10-11P60412 298 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01551Q86U37 167 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 SVBPQ8N300 66 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 TVP23CQ96ET8 276 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 ASCL2Q99929 193 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms